Aynı problem benimde başıma gelmişti. Kaynak kodunu incelemek için indirip çalıştırdığım Amonyak54 sourcesi yüzünden bendede uygulama iconları değişiyordu. Kasten yapılmış backdoor olduğunu sanmıyorum çünkü kodlarda bariz değiştirilmiş birşey yoktu. Uygulamanın son derlendiği PC den bulaşmış olmalı... Rardan çıkartsanızda iconlar otomatik değişiyor bunun haricinde bir zararı yok.
Çözüm için; icon cache reset kodlarını deneyebilirsiniz.